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从头合成最长复杂寡核苷酸,1005碱基,用于AAV载体,相关公司已获7320万美元融资
发布日期:2023年04月03日 发布人:admin
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202339日,下一代酶促 DNA 合成的先驱Ansa Biotechnologies, Inc.宣布,成功在单次合成中从头合成有史以来最长的 DNA 寡核苷酸,长度为1005个碱基序列,这将是一个里程碑的事件。

   以行业领先的准确度合成 1005 碱基寡核苷酸

目前,科学家对用于细胞和基因治疗、蛋白质工程、生物制造以及基础生命科学研究等应用的基因长度合成 DNA 的需求不断增加。

寡核苷酸合成的金标准,即核苷亚磷酰胺法其可生产的寡核苷酸的长度和质量方面已经达到上限。一些较长的序列是通过将较短的寡核苷酸“缝合在一起”而制成的,但该过程难以处理包含某些特征(例如二级结构、重复以及高或低 GC 含量)的序列这些特征通常对 DNA 的功能至关重要。

此次Ansa 合成的1005碱基序列编码,是用于基因治疗开发的 AAV 载体的关键部分,包含了强二级结构和高 GC 含量。Ansa 的方法无需寡核苷酸的组装,而是利用专有的全酶解 Ansamer ,快速直接将它们合成为单个超长寡核苷酸

Ansamerd的核心是TdT(不依赖于模板的末端脱氧核苷酸转移酶)-dNTP (单个脱氧核糖核苷三磷酸)偶联物的固体支持物。这种专利的聚合-核苷酸结合试剂一次可以快速扩展一个 DNA 分子一个碱

偶联物使用其连接的 dNTP 延伸引物,然后保持共价连接到 3' 端,阻止其他偶联物进一步 延伸引物(1. Extend);切割接头会从引物中释放 TdT,从而实现后续延伸(2. De-block)。



 

使用标准分子生物学技术克隆“Ansamer™”寡核苷酸,发现其含有约 28% 的序列完美分子,表明其合成过程中的平均逐步产量约为 99.9%,处于行业领先水平。

   寡核苷酸合成的下一个前沿是基因序列的直接合成

自 60 多年前第一种化学寡核苷酸合成方法问世以来,可合成寡核苷酸的长度和质量的改进开启了新的应用,改变了我们与自然界的关系。合成 20-30 个碱基分子的能力使 PCR 和 DNA 测序得以发展,这为重组 DNA 技术和分子诊断学奠定了基础。50-100 个碱基分子的合成使精确操作 DNA 的新技术成为可能,包括定点诱变和基因工程。今天,高达 350 个碱基的寡核苷酸的高通量合成使全基因组 CRISPR 实验和蛋白质工程的新方法成为可能。

1005碱基寡核苷酸的合成代表了该领域的一个重要里程碑,超出了许多人的想象,”Ansa Biotechnologies 首席执行官兼联合创始人 Daniel Lin-Arlow 博士说。“我们极长的 Ansamer 寡核苷酸将使我们能够更快、更可靠地为研究人员制造基因构建体,并且序列限制比目前可能的更少。”

目前,Ansa 已经获得累计7320万美元的融资,投资人包括Northpond Ventures ,李嘉诚旗下的维港投资等。并且,其正在开发一系列针对特定生产能力和下游应用量身定制的高度多路复用的定制仪器。

Ansa Biotechnologies 的首席技术官兼联合创始人 Sebastian Palluk 表示:“我们在技术平台的发展方面取得了快速进展,但这仅仅是个开始。“我们的技术有可能彻底改变生命科学研究和生物工程。”

Ansa 将于 2023 年 4 月启动克隆合成基因的早期访问计划。获得 Ansa 高度复杂的克隆 DNA 将使科学家能够探索他们以前无法探索的领域,因为这些序列太难合成了。

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